本系通過IEET工程與科技教育認證，培育學生成為化工生技微跨領域之優秀科學家、工程師與產業的將帥。
本系之課程規劃分成二領域：
- 化學工程：在新興產業中如半導體製程、光電高分子材料、生物科技及能源技術等，均牽涉到許多化工相關知識。
- 生物科技：涵蓋生命、生化、植物科技、醫學、藥物、食品、醫材與生醫工程等領域。
本系擬招收有志於學習化學工程、生物科技等專業相關知識，並培育有志成為高科技產業工程師之學生，領域包含化工技術、再生能源、尖端光電、高分子材料、生物科技、生物醫學與食品技師等，著重跨領域學習及實務操作，以強化產業經驗與就業優勢。
目前專任師資有教授11名、副教授8名、助理教授2名、講師1名，共計22名；兼任師資有教授8名、副教授1名、助理教授1名、講師5名，共計15名。
擁有大同大學實驗大樓3至8樓完整獨立的空間以及挺生大樓7至8樓完整獨立的空間，包含教室、學生公共活動空間、樂學中心、教學實驗室、貴重儀器室、教師個人研究室與教師辦公室間會議室與系所辦公室等空間。設備於教學實驗及研究部分皆有足夠之資源，提供學生與教師進行優質教學與研發環境。
為提升高等教育品質，培育跨領域人才，提高就業競爭力，推動跨領域學程，接軌國際發展趨勢，透過化學工程學系及生物工程學系的系所整併，進行師資、課程、設備、空間等資源的整合，使新學程得以專業優勢互補而更趨於完整，以創造新學程優質、精緻、跨領域之特色。